Ubuntu 14.04 Spark单机环境搭建与初步学习

最近课设需要学习,预先学习了一波。

注意:本文首次撰写于2016-12-27,最近修改时间为2016-12-27,请注意相关程序的可用性与安全性。

安装与配置

大数据这个领域是热火朝天,而Apache Spark则是一个炙手可热大数据神器。趁着现在还比较有空,赶紧学习Spark方面的东西。

这一小节主要是记录下在Ubuntu 14.04下搭建Spark单机环境的过程1。这个过程主要有四个部分:

  • 安装Java
  • 安装Scala
  • 安装Spark
  • 安装sbt

安装Java

  • 下载Java SE,然后解压
    # wget http://download.oracle.com/otn-pub/java/jdk/8u112-b15/jdk-8u112-linux-x64.tar.gz?AuthParam=1482801228_c2a115fb9b0cbc9f160e02b5c29212c7
    # mv jdk-8u112-linux-x64.tar.gz\?AuthParam\=1482801228_c2a115fb9b0cbc9f160e02b5c29212c7 jdk-8u112-linux-x64.tar.gz
    # tar -zxvf jdk-8u112-linux-x64.tar.gz -C /opt/
    

    这里需要解释下为什么这么做:因为我直接从Java官网上下载的,而官网下载之前需要确认协议,如果直接复制官网下载地址则会出现下载的是个网页的情况。所以只能通过一个带有AuthParam序号的下载地址下载后再修改文件名了。如果有更好的方法的朋友,请联系我告知。谢谢!2016-12-27 12:05:05

  • 配置环境变量Ubuntu的环境变量又好几个地方可以配置,我这里配置的是/etc/profile文件。
    export JAVA_HOME=/opt/jdk1.8.0_112
    export JRE_HOME=${JAVA_HOME}/jre
    export CLASSPATH=.:${JAVA_HOME}/lib:${JRE_HOME}/lib
    export PATH=${JAVA_HOME}/bin:${JRE_HOME}/bin:$PATH
    
  • 之后重启服务器,或者输入source /etc/profile命令,使环境变量生效,检验Java有没配置成功
    $ java -version
    java version "1.8.0_60"
    Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_60-b27)
    Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.60-b23, mixed mode)
    $ javac -version
    javac 1.8.0_60
    

安装Scala

Scala安装过程和Java的类似,比较简单

  • 官网下载压缩包,然后解压
    # mkdir /opt/scala
    # wget http://downloads.lightbend.com/scala/2.12.1/scala-2.12.1.tgz
    # tar -zxvf scala-2.12.1.tgz -C /opt/scala/
    
  • 配置环境变量 /etc/profile
    export SCALA_HOME=/opt/scala/scala-2.12.1
    export PATH=${SCALA_HOME}/bin:$PATH
    
  • 重启服务器,或者输入source /etc/profile命令,使环境变量生效,测试一下
    # scala -version
    Scala code runner version 2.11.7 -- Copyright 2002-2013, LAMP/EPFL
    

安装Spark

  • 官网下载压缩文件。这里我选择的是2.0.2版本的Pre-build for Hadoop2.7 and later. 解压
    # mkdir /opt/spark
    # wget http://download.nextag.com/apache/spark/spark-2.0.2/spark-2.0.2-bin-hadoop2.7.tgz
    # tar -zxvf spark-2.0.2-bin-hadoop2.7.tgz -C /opt/spark/
    
  • 配置环境变量 /etc/profile
    export SPARK_HOME=/opt/spark/spark-2.0.2-bin-hadoop2.7
    export PATH=${SPARK_HOME}/bin:$PATH
    

    重启服务器,或者输入source /etc/profile命令,使环境变量生效。

    到这里,应该就可以启动spark-shell,跟着Spark官网上的教程来学API了。

安装sbt

安装sbt我参考的是这篇文章ubuntu14手动安装sbt

  • 官网下载解压
    # mkdir /opt/scala/
    # wget https://dl.bintray.com/sbt/native-packages/sbt/0.13.13/sbt-0.13.13.tgz
    # tar -zxvf sbt-0.13.13.tgz -C /opt/scala/
    # cd /opt/scala/
    # mv sbt-launcher-packaging-0.13.13 sbt
    
  • 配置环境变量 /etc/profile
    export SBT_HOME=/opt/scala/sbt
    export PATH=${SBT_HOME}/bin:$PATH
    
  • 建立启动sbt的脚本
    # mkdir /opt/scala/sbt/
    # cd /opt/scala/sbt/
    # touch sbt
    
    # 脚本内容如下,注意sbt-launch.jar的路径
    SBT_OPTS="-Xms512M -Xmx1536M -Xss1M -XX:+CMSClassUnloadingEnabled -XX:MaxPermSize=256M"
    java $SBT_OPTS -jar /opt/scala/sbt/bin/sbt-launch.jar "$@"
    
  • 修改sbt文件权限
    # chmod u+x sbt
    
  • 测试sbt
    # sbt sbt-version
    Getting org.scala-sbt sbt 0.13.13 ...
    

[info]

Set current project to kaka (in build file:/home/kaka/)

[info]

0.13.13

第一次执行的时候会下载很多东西,然后因为国内你猜到的原因,这一步会比较慢,也很有可能会失败。可以通过如下步骤设置国内的sbt源 2 3

#vim ~/.sbt/repositories

在里面输入如下内容:

[repositories]
  local
  oschina:http://maven.oschina.net/content/groups/public/
  oschina-ivy:http://maven.oschina.net/content/groups/public/, [organization]/[module]/(scala_[scalaVersion]/)(sbt_[sbtVersion]/)[revision]/[type]s/[artifact](-[classifier]).[ext]

不过这个并没有成功,目前来看还是因为你懂得的原因,正在寻找解决方案。2016-12-27 12:34:43

到此为止,Spark的单机环境就搭建完毕,下一步就是认真地学习Spark了。

初识Spark

这一小节主要介绍下Spark相关语法与操作指南。4

Spark 终端

我觉得 Spark 非常亲民的一点是它提供了一个交互式的命令行终端,这样用户就可以快速地测试一些命令和语句,而无需每次都保存代码脚本然后调用执行,这对于 R 和 Python 用户来说是非常顺心的一件事。如果已经将 Spark 的 bin 目录加入到了系统路径,那么在系统命令行里输入 spark-shell 就可以进入 Spark 的交互式终端了。

如果出现了像图中 scala> 这样的提示符,就说明 Spark 安装成功。这里的 scala 指的是 Scala 编程语言。前面说了,Spark 主要使用 Scala 来进行开发,这意味着要最大程度地发挥 Spark 的性能,还需要再多学一门编程语言(Spark 还支持 Java 和 Python 的接口,但 Java 的语法没有 Scala 简洁,Python 的性能没有 Scala 的高)。虽然这需要花费一些额外的时间,但好在 Scala 的语法非常直观,基本上通过例子就可以模仿写出自己的程序来。

如果对 Scala 语言感兴趣,可以参考这份教程来了解其基本的语法。但在这里我们将直接进入正题,用 Spark 来跑一个回归的例子。

Spark 例子:回归模型

Spark 的数据分析功能包含在一个称为 MLlib 的组件当中,顾名思义,这是 Spark 的机器学习库,而回归是它支持的模型之一。为了演示例子,我们首先用 R 生成一组模拟的数据(是不是感觉怪怪的,主要是我还没用熟 Scala):

set.seed(123)
n = 1e6
p = 5
x = matrix(rnorm(n * p), n)
b = rnorm(p)
y = x %*% b + rnorm(n, 1, 3)
z = data.frame(y, x)
write.table(z, "reg.txt", sep = " ", row.names = FALSE, col.names = FALSE)

我们将数据保存为 reg.txt 文件,它共有一百万行,每一行有6个数,用空格分隔,其中第一个数代表因变量,其余的为自变量。

下面就是一段用 Scala 实现的 Spark 算回归的程序,其中包括了读取数据,拟合回归,计算回归系数,进行模型预测以及计算 R2R2 的过程。将这段程序复制到 Spark 的终端里,就可以迅速查看输出结果,体验 Spark 的基本功能了。

import org.apache.spark.mllib.linalg.Vectors
import org.apache.spark.mllib.regression.LabeledPoint
import org.apache.spark.mllib.regression.LinearRegressionWithSGD
import org.apache.spark.mllib.stat.Statistics

val raw = sc.textFile("reg.txt")

val parsed = raw.map({ line =>
    val split = line.split(' ') // 字符串按空格切分
    val y = split(0).toDouble   // 第一个数转成Double型,是因变量
    val x = split.tail.map(_.toDouble) // 其余的转成自变量向量
    LabeledPoint(y, Vectors.dense(x))  // 把因变量和自变量打包
}).cache()

println(parsed.count())

val model = new LinearRegressionWithSGD()

model.optimizer.setNumIterations(100)
model.setIntercept(true)

val tstart = System.currentTimeMillis()
val res = model.run(parsed)
val tend = System.currentTimeMillis()

println("Model training time: " + (tend - tstart) / 1000.0 + " secs")

println(res.intercept)
println(res.weights)

val pred = res.predict(parsed.map(_.features))

val r = Statistics.corr(pred, parsed.map(_.label))
println("R-square = " + r * r)

下面我们来解释一下程序中每一部分的含义。开头1到4行的是一系列的 import 语句,目的是使用一些已经封装好的类,与 R 中的 library() 和 Python 的 import 语句类似。另外,相信不少读者立刻就能看出这是 Java 风格的导入语句。事实上,Scala 正是基于 Java 而开发的,因此其语法也大多脱胎于 Java。

第6行是读取数据,并将结果赋值给一个变量 raw。特别需要指出的是,这条语句实际上并没有开始读取文件,而只是建立了数据与程序之间的一种连接。这一点是与 R 中 read.table() 最大的不同。

第8到第13行其实包含了两条操作,第一是调用了 raw 对象的 map() 方法,之后连着的是 cache()方法。map() 相当于 R 中的 apply(),意思是对读进来文件的每一行进行一次变换,然后将结果返回,组成一个新的向量。之所以需要这么做,是因为 Spark 读取文本文件时把每一行当作了一个字符串,因此我们需要从这个字符串中解析出我们需要的数据来。语句中被大括号包括的部分其实就是定义了这样一个变换函数,其输入是参数 line,代表传入函数的那个字符串,而输出是一个 LabeledPoint 对象,它是 MLlib 中定义的一个数据结构,用来代表一个因变量-自变量的配对观测。map() 方法返回的结果,就是一个长度为一百万,每个元素为 LabeledPoint 类型的向量。

接下来的 cache() 方法是 Spark 非常独到的一个操作,它是为了告诉 Spark,只要内存足够(限额可以通过 Spark 中的配置文件设置),就将数据放到内存里,以加快后续程序的运算速度。如果内存放不下,就依然保存到硬盘中。这样的好处在于,一方面避免了 R 把所有对象都往内存放的操作,另一方面避免了 Hadoop 这种重度依赖硬盘,以至于效率低下的情形。

而有趣的是,执行完这一句后,数据其实还没有进行真正的读取。这是因为 Spark 采用了一种“延迟运行”的机制,意思是数据只有在真正用到的地方才开始运算,其理念就是,“只要老师不检查作业,我就暂时不写”。基于这个原因,数据只有到了下面 parsed.count() 这句需要计算样本量时才真正开始进行读取和变换。

接下来的第17到26行就是真正拟合回归模型的时候了。MLlib 里拟合回归采用的是随机梯度下降法(SGD),选用这种算法的原因,一是因为它是一种迭代算法,可以通过设置迭代次数来随时终止计算(当然同时会损失一部分精度),这对于大规模的数据是非常关键的,因为通常在这些场合下我们不要求结果非常精确,但却希望计算能在规定的时间里完成。而另一个原因就在于这种算法可以比较容易地进行并行,扩展性较好。

第17行中,我们先建立模型对象,然后在19、20行设置最大迭代次数以及告诉模型应该包括截距项。22和24行插入了两句获取时间的函数,是为了评估模型训练(23行)花费的时间。

在第31行中,我们用拟合出的模型对训练集本身进行了预测。parsed.map(_.features) 的目的是取出训练集中的自变量部分,而 predict() 方法返回的结果就是因变量的预测值向量。

最后的第33行,我们利用 MLlib 为我们封装好的 corr() 函数计算了预测值与真实值之间的相关系数(parsed.map(_.label)parsed.map(_.features) 相对,是取出训练集中的因变量),将它平方一下,就是模型的 R2R2 值了。

学习资源

下面几个链接我觉得对于 Spark 入门是非常有帮助的:

伯克利的 Spark 迷你课程

Spark 官方快速入门教程

MLlib 官方文档

参考资料与文献

曾梦想仗剑走天涯. Ubuntu 14.04 Spark单机环境搭建[EB/OL]. http://kwangka.github.io/2015/10/15/installspark/.

SegmentFault. 加速SBT下载依赖库的速度[EB/OL]. http://segmentfault.com/a/1190000002474507.

sbt. Proxy Repositories[EB/OL]. http://www.scala-sbt.org/0.13/docs/Proxy-Repositories.html.

怡然轩. 极简 Spark 入门笔记——安装和第一个回归程序[EB/OL]. http://yixuan.cos.name/cn/2015/04/spark-beginner-1/.